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Registres européens de ressources biologiques et dataverse RARe

Dans un contexte de développement de l’Open science, les infrastructures de recherche forment ainsi la base d’un espace numérique européen ouvert. Les membres de RARe ont mis en place des services innovants de gestion de données reconnus en Europe.

Registres européens de collections RARe

IMAGE Data Portal  : Innovative Management of Animal Genetic Resources. Le portail web du projet IMAGE intègre les données des banques de gènes et des collections avec les données génomiques, les données des systèmes d'information géographique et d'autres informations générées dans le cadre du projet H2020 IMAGE, par le pilier animal de RARe. IMAGE|Home (image2020genebank.eu)

Catalogue de ressources microbiennes (et données associées) : MIRRI offre à ses utilisateurs un point d'accès unique à plus de 400 000 ressources microbiennes de haute qualité, dont le nombre ne cesse de croître et qui sont mises à disposition par plus de 50 bioréférentiels partenaires. Ces ressources couvrent tous les types de micro-organismes, tels que les bactéries (et leurs bactériophages), les archées, les champignons (y compris les levures), les virus eucaryotes, les micro-algues et d'autres matériaux microbiologiques tels que les lignées cellulaires, les constructions naturelles ou les constructions portant des plasmides, les bibliothèques d'ADN, et l'ADN génomique. Le système d'information MIRRI fournira également aux utilisateurs toutes les informations pertinentes et les données contextuelles associées (métadonnées) sur les ressources microbiennes, selon leur disponibilité - par exemple, taxonomie, écologie, pathogénicité, morphologie, physiologie, caractérisation chimique, codage à barres de l'ADN ou génomique. Microbial Resources & Data – MIRRI-ERIC

Portail de données FAIDARE : L'objectif de ce portail est de faciliter la découverte de données publiques sur la biologie végétale à partir d'une fédération de dépôts de données établis. Il est basé sur les spécifications de la Breeding API (BrAPI) et facilite l'accès aux ensembles de données sur le génotype et le phénotype des plantes cultivées et forestières par le biais d'une interface web facile à utiliser. Il s'agit d'une extension du portail générique Data-Discovery. Il a été développé par INRAE-URGI en collaboration avec Elixir Plant, Phenome-Emphasis.fr et Elixir-fr/IFB. FAIR Data-finder for Agronomic REsearch (inrae.fr)

Catalogue européen de recherche des ressources phytogénétiques EURISCO : Le portail fournit des informations sur plus de 2 millions d'accessions de plantes cultivées et de leurs parents sauvages, conservées ex situ par environ 400 instituts. Il est basé sur un réseau d'inventaires nationaux de 43 pays membres et représente un effort important pour la préservation de la diversité agrobiologique mondiale en fournissant des informations sur la grande diversité génétique conservée par les institutions collaboratrices. Home (ipk-gatersleben.de)

Dataverse de RARe sur recherche.data.gouv.fr

Recherche Data Gouv, un écosystème au service du partage et de l’ouverture des données de recherche

Logo Data Gouv

La recherche est face à un défi majeur : préserver, partager et ouvrir les données pour favoriser une science ouverte, plus transparente et plus cumulative au service de tous, les équipes de recherche et de la société dans son ensemble. Recherche Data Gouv a été pensé pour soutenir les équipes de recherche dans leur travail de structuration des données pour les rendre Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables, Réutilisables, c’est-à-dire conformes aux principes "FAIR". Chaque acteur de l’écosystème Recherche Data Gouv contribue au rayonnement de la recherche française par le partage et l’ouverture des données.  L’ambition de Recherche Data Gouv : devenir un service de l’European open science cloud (EOSC), offrant un accès au patrimoine des données partagées et ouvertes de la recherche pour favoriser leur réutilisation !