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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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AgroBRC - RARe Ressources agronomiques pour la Recherche

Le numéro spécial de la revue NOV’AE, ingénierie et savoir-faire innovants dédié à l’infrastructure RARe vient de paraître !

Numéro spécial RARe de la revue NOV’AE
Découvrez les activités et ressources de l’infrastructure RARe dont les CRB agronomiques sont au cœur de grands enjeux de recherche pour le futur. RARe rassemble les ressources biologiques animales, environnementales, végétales, microbiennes et forestières, avec le soutien des organismes de recherche INRAE, CIRAD et IRD. Ce numéro spécial «Innovations dans le domaine des Ressources Agronomiques pour la Recherche » présente un panel de l'immense diversité des ressources de RARe.

Comment fonctionne une banque d’échantillons pour la recherche ?

Les Centres de Ressources Biologiques (CRB) sont le résultat d’une longue évolution des pratiques et organisations. Ils doivent satisfaire à des critères élevés de qualité et d’expertise pour les besoins de la recherche : collecte, caractérisation, conservation et distribution des ressources biologiques. A l’aide d’exemples, découvrez ces missions et les dernières innovations choisies parmi les cinq piliers de l’infrastructure de recherche RARe qui rassemble les ressources biologiques animales, environnementales, végétales, microbiennes et forestières, avec le soutien des organismes de recherche INRAE, CIRAD et IRD.

L'infrastructure nationale de recherche RARe : un réseaux de Centres de Ressources Biologiques (CRB)

Depuis plus de 20 ans, les organismes acteurs de la recherche agronomique ont développé l’organisation de réseaux en métropole et en outre-mer autour des ressources biologiques, avec les Centres de Ressources Biologiques (CRB). L’infrastructure nationale de Recherche RARe (Ressources Agronomiques pour la Recherche) a été créée en 2015 avec le soutien de ces institutions (INRAE, CIRAD, IRD) et leurs partenaires (CNRS, IFREMER, INSERM, ANSES, écoles agronomiques et vétérinaires, universités…).

En 2016, RARe a été inscrite sur la feuille de route nationale des infrastructures de recherche en Biologie Santé. Le calcul des coûts complets 2017 des infrastructures a placé RARe parmi les plus importantes, avec un coût total d’environ 22 M€. Le Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation a renouvelé son soutien en maintenant RARe sur la feuille de route nationale des infrastructures de recherche pour les années 2021 à 2024.

Les ressources conservées par les CRB, membres de RARe, constituent à la fois un patrimoine et un atout pour le futur. Ce patrimoine issu d’années de recherche, d’innovation et de développement permet de mener les recherches futures destinées à répondre aux grands enjeux de recherche qu’elle soit fondamentale (connaissance du vivant, individus ou écosystèmes, compréhension de la dynamique de la biodiversité…) ou de société (adaptation au changement climatique, services écosystémiques, alimentation, santé, biotechnologie…). Les CRB sont regroupés en cinq piliers, définis soit par la nature biologique des ressources, soit par la finalité des recherches. Les activités sont réalisées dans le respect des exigences de traçabilité.

C’est un contexte très original et assez unique. Au-delà de l’immense diversité des ressources de l’infrastructure RARe, les équipes travaillent à constituer, conserver et diffuser des collections avec des problématiques proches. RARe développe des activités transversales pour stimuler des synergies entre ses piliers, notamment pour la mise en place de la politique FAIR pour les données, la réglementation APA pour les échanges, et le management de la qualité pour le fonctionnement des CRB.

L’enjeu est de permettre à l’agriculture et à l’élevage de s’adapter aux conditions futures et de faire face aux nouveaux défis pour les générations futures. Les CRB sont au cœur de nombreux programmes de recherche destinés à explorer le vivant et les écosystèmes ainsi qu’à valoriser la biodiversité pour l’agriculture et l’industrie, l’alimentation, l’environnement et la santé.

A l’échelle internationale, l’infrastructure est membre du Global Genome Biodiversity Network ; ses membres participent à des réseaux ou consortiums européens. Son pilier micro-organisme est le nœud français de l’infrastructure européenne MIRRI.

Contact :

A télécharger

Consulter le numéro spécial NOV'AE " Innovations dans le domaine de Ressources Agronomiques pour la Recherche (lien NOV'AE)

Voir aussi

Sommaire  

Entrée en collection

  • Processus introduction, démarches et outils pour la gestion sanitaire des collections de fruits à noyaux du CRB Prunus-Juglans
  • Collecte d’échantillons dans le cadre du Centre de Ressources Biologiques Colisa (collection of ichtyological samples)
  • Projet BrasExplor : élargir les ressources génétiques du CRB BrACySol pour Brassica oleracea et Brassica rapa
  • Enrichir les catalogues des CRB : l’exemple des collections microbiennes des Centres de Ressources Biologiques du CIRM
  • Cani-DNA, un CRB qui a du chien ! Réseau de collecte de prélèvements de chiens par les vétérinaires pour la recherche biomédicale et la diversité génétique

Conservation

  • Conserver les communautés microbiennes associées aux plantes viables et fonctionnelles : premiers résultats
  • La cryoconservation des cellules germinales souches chez la truite arc-en-ciel : une stratégie pour restaurer l’intégralité d’un génotype d’intérêt
  • Conserver les sols : pourquoi et comment ?
  • Cryoconservation d’apex de Solanum tuberosum et espèces apparentées par la technique de vitrification en gouttes
  • Développement d’une core collection pomme de terre
  • Culture in vitro, assainissement et indexation de la Collection Igname du Centre de Ressources Biologiques Plantes Tropicales des Antilles

Gestion du stockage des échantillons

  • Évaluer l’effet du temps et de la méthode de conservation du matériel végétal sur la quantité et la qualité de l’ADN extrait
  • Entretenir des collections d’invertébrés d’intérêt agronomique sur hôtes vivants : un enjeu patrimonial et des contraintes spécifiques

Caractérisation

  • Interprétation de l’âge à partir des écailles sur des espèces de salmonidés lacustres, le corégone (Coregonus sp.) et l’omble chevalier (Salvelinus alpinus)
  • Les automates de phénotypage à haut débit du CIRM
  • Le Centre ARCAD à Montpellier : conserver l’agrobiodiversité pour adapter les cultures aux changements climatiques et aux nouvelles pratiques agricoles
  • La spectrométrie de masse MALDI-TOF : un outil de diagnostic pour l’identification et le typage des bactéries pathogènes des poissons
  • Caractérisation de la collection caprine de la Cryobanque nationale pour une meilleure gestion des races menacées
  • SAMBO : Biobanking et extraction automatisée d’ADN de microbiotes

Distribution

  • Les outils de suivi de la relation client d’un Centre de Ressources Biologiques
  • Présentation du portail d’accès aux ressources biologiques du pilier animal de RARe

Support

  • Déploiement de Systèmes de Management de la Qualité dans les Centres de Ressources Biologiques de l’Infrastructure de Recherche RARe
  • Bonnes pratiques en valorisation de micro-organismes
  • La mise en oeuvre des réglementations sur l’accès aux ressources génétiques et le partage des avantages (APA) dans les Centres de Ressources Biologiques membres de RARe
  • BioloMICS : Un outil pour gérer les données associées aux collections des Centres de Ressources Biologiques

Conclusion

  • Quelles perspectives pour RARe en Europe et dans le monde ?